Os Frades Menores Franciscanos instalaram-se na Terra Santa desde o século XIII, época de São Francisco, que manifestou uma atenção particular ao berço do cristianismo, tendo ele mesmo visitado no ano de 1219, quando por sua viagem ao Oriente Médio em que aconteceu seu célebre encontro com o Sultão do Egito, em sua pregação pela paz e concórdia entre os povos e religiões. A guarda dos santuários da Terra Santa foi confiada pela Igreja à Ordem Franciscana mediante a Bula Gratias Agimus de 21 de novembro de 1342. A ordem franciscana guardou até hoje sua presença ininterrupta , através de todos esses oito séculos. Em sua visita à Terra Santa, o Papa João Paulo II fez a seguinte exortação: “Os franciscanos não interrompam jamais sua benéfica presença, apesar das inúmeras dificuldades ao longo de todos esses séculos. Empenham-se generosamente na conservação das antigas memórias, na construção de novos santuários, na animação litúrgica e no acolhimento aos peregrinos”.

O Comissariado da Terra Santa é uma espécie de filial da Custódia da Terra Santa, confiado aos frades de algumas Províncias e Nações onde existem Frades Menores. O Comissariado tem a missão de divulgação dos Lugares Santos, promover a devoção e manter a subsistência dos frades, dos cristãos e dos santuários instalados na terra natal de Jesus. Promove também peregrinações, onde milhares de cristãos, pessoas do mundo todo visitam os Lugares Santos. Tendo em vista tais atividades, o Comissariado promove em modo oficial junto às Dioceses de sua circunscrição a Coleta Pontifícia da Terra Santa e das Igrejas Orientais, que se realiza na Sexta-feira da Paixão e a encaminha à Custódia da Terra Santa. Dentro de cada Comissariado, existe também a Irmandade da Terra Santa, instituída pela Igreja para a propagação e manutenção dos Santos Lugares da Palestina, palco dos Mistérios de nossa Redenção. É uma obra que se baseia no espírito missionário de São Francisco de Assis. Tal obra leva a solidariedade aos cristãos que vivem na Terra Santa.

A Irmandade da Terra Santa mantém uma rede de zeladores e zeladoras, que fazem o elo de ligação com seus membros (benfeitores e benfeitoras dos Lugares Santos). Ao se tornar membro da Irmandade, a pessoa recebe um diploma da Irmandade como lembrança de que a mesma está em comunhão com a presença das comunidades cristãs e com a missão dos franciscanos na Terra Santa. Em resposta a este gesto de comunhão e solidariedade, os frades franciscanos se comprometem a diariamente celebrarem missas pelos benfeitores, quer estejam vivos ou que já tenham falecido, inscritos na Irmandade participando assim de todas a obras de piedade praticadas nos santuários da Terra Santa, dentre estes, o Santo Sepulcro, a Basílica da Natividade em Belém e a Basílica da Anunciação em Nazaré, entre outros.